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Hi-C辅助基因组组装

技术介绍       数据分析       经典案例       常见问题



技术简介



       Hi-C技术源于染色体构象捕获技术,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质三维结构信息。基于Hi-C数据中染色质片段间的交互强度呈现出随距离衰减的规律,Hi-C可以用于基因组组装,将杂乱的基因序列组装到染色体水平。该技术可以利用单个个体就可以将基因组序列定位到染色体水平,从而进行染色体水平的研究。现在已经证明Hi-C技术在人、小鼠、果蝇、拟南芥等基因组辅助组装中取得了较好的效果。


技术优势



            1、具有更高的覆盖率和特异性,覆盖率高达95%;
            2、无需繁琐的群体构建工作,单个个体即可完成染色体水平组装;
            3、可适用于难以构建遗传图谱的物种基因组。


样本要求



基因组DNA ≥10ug;细胞 ≥5×106个;组织≥40mg


实验周期



60天



       生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等测序平台,可为研究者提供多样化的测序和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊,平均影响因子达到6。


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