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circRNA测序

技术介绍       数据分析       经典案例       常见问题




技术简介


       环状RNA(circRNA)是一类环状的非编码RNA,广泛存在于各类生物中。由于环状RNA能够发挥竞争性内源RNA作用,顺式调控基因的表达,同时,环状RNA有较强的组织表达特异性,不易降解,具有biomarker的潜力,逐渐成为研究热点。环状RNA测序(CircRNA Sequencing)能够对样品中的所有circRNA建库、测序获得所有已知与未知的circRNA分子,已成为circRNA表达高通量研究的主要手段。


       生因生物circRNA测序采用Illumina Hiseq 4000平台进行测序,针对各类样本开展准确的circRNA鉴定,表达分析。已有多篇文献发表于各类顶级期刊。



数据分析



            circRNA分析

            circRNA鉴定(多种算法)    差异circRNA表达分析    来源基因GO/PATHWAY分析    microRNA结合位点预测




样本要求




细胞 ≥1×107个;组织 ≥50mg;Total RNA ≥10ug;



实验周期



35天



       生因生物分析团队已完成上千个项目的个性化数据分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等测序平台,可为研究者提供多样化的测序和个性化的数据分析服务。多篇文献发表在Nature、Science、Cell等顶级期刊,平均影响因子达到6。


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